Фамилия Илигорская — редкий случай в русском ономастиконе. Её форма с суффиксом -ск- характерна для фамилий, образованных от географических названий. В основном так складывались фамилии дворянского происхождения или тех, кто получил фамилию по месту жительства или владения. Но есть нюанс: топоним «Илигоры» или «Илигорск» не прослеживается ни в одном известном географическом справочнике. Это не значит, что его не существовало — мелкие селения, хутора или урочища могли исчезнуть или не попасть на карты.

Более вероятная версия — искусственное происхождение фамилии. В XIX веке, особенно в духовной среде, семинаристам часто давали фамилии, образованные от красивых, книжных или греко-латинских корней. «Илигорская» может быть переосмыслением слов «Илион» (Троя) и «гора» — то есть «Троянская гора», что звучало возвышенно. Или же в основе лежит греческое «ἥλιος» (helios — солнце) и «горы»: «Солнечные горы». Такая фамилия могла быть дана будущему священнику как символ света или благодати.

Нельзя исключать и польское влияние. Суффикс -гор- (góra — гора) в сочетании с начальным «Или» мог возникнуть на западнорусских землях, где фамилии на -ский были особенно распространены среди шляхты. В этом случае Илигорский мог означать выходца из местечка, название которого со временем стёрлось из памяти.

Сегодня фамилия Илигорская встречается крайне редко, в основном в центральной России и в среде потомков духовенства. Её носительницы могут обнаружить корни в семинарских списках XIX века или в метрических книгах юго-западных губерний. Точного ответа о происхождении нет — перед нами результат либо утраченного топонима, либо книжной фантазии, что само по себе делает фамилию необычной.