Фамилия Илтус (встречается также написание Ильтус) не имеет однозначной этимологии, и исследователи предлагают несколько версий её происхождения. Самая географически привязанная гипотеза связывает фамилию с гидронимом Ильта — рекой в Барышевском районе Киевской области Украины. Если это так, то основатель рода мог получить прозвище по месту жительства на берегу этой реки. Происхождение самого названия Ильта возводят к ламутскому (эвенскому) слову «ильта» — «корюшка», что указывает на рыбные богатства водоёма.

Другая версия уводит на северо-запад: фамилия могла возникнуть в среде еврейского населения Прибалтики. В этом случае в основе лежит финское слово ilta — «вечер». Суффикс -ус, который мы видим в окончании, типичен для литовских и латышских фамилий, что делает прибалтийский след вполне правдоподобным.

Третья гипотеза предполагает восточное происхождение: от имени Ильдус, которое с персидского переводится как «друг своей страны, своего народа». Косвенным доводом в пользу этой версии служит география: многие носители фамилий Илтус и Ильтус живут в Одессе и на юге Украины — регионе, где исторически были сильны контакты с тюркоязычным населением. Какая из трёх версий верна для конкретной семьи, можно попробовать установить только по архивным записям и семейным преданиям.