Фамилия Имангужанова — составная, и её значение складывается из двух тюркских имён, соединённых в одно. Первая часть восходит к мужскому имени Иман, которое в переводе с арабского означает «вера», «верование», в первую очередь — вера в Аллаха. Вторая часть — имя Гужан, более редкое и многозначное: его трактуют и как «хозяин», «владелец», «господин», и как «обладающий большими знаниями», «наставник», «учитель». Таким образом, в основе фамилии лежит двусоставное личное имя Имангужан — человек, чья вера сочетается со статусом наставника или хозяина.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к полной форме имени Имангужан добавили русский патронимический суффикс -ов, а затем — типичное для женских фамилий окончание -а. Такая модель характерна для тюрко-русского пограничья: фамилию фиксировали по отцу, записывая его имя в притяжательной форме. В мужском варианте фамилия звучала бы как Имангужанов.

Процесс формирования фамилий у тюркских народов был длительным и неравномерным, поэтому точное место и время появления рода Имангужановых без генеалогических изысканий назвать сложно. Однако сама конструкция указывает на регионы, где русская административная система накладывалась на тюркскую антропонимию — скорее всего, Поволжье, Приуралье или Казахстан. Встречаются и однокоренные варианты: Имангулов, Иманбаев, Гужанов, — но именно сдвоенная основа «Иман + Гужан» встречается реже, что делает фамилию заметной даже в пределах одной языковой группы.