Фамилия Имерцаки — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа и суффикс выдают нетипичное для славянских фамилий происхождение. Если фамилии на -ов, -ин, -ский в России исчисляются миллионами, то окончание -аки прямо указывает на греческие или молдавские корни. В греческом суффикс -акис (-άκης) образует уменьшительные формы и фамилии, особенно распространённые на Крите. В молдавском языке (и в исторической Бессарабии) суффикс -ак (-аки) также встречается, но чаще в прозвищах.

Основа «Имерц» — самая загадочная часть. Вероятнее всего, она восходит к греческому слову «ήμερος» (имерос) — «ручной», «кроткий», «приручённый». В таком случае Имерцаки — это «маленький ручной» или «сын кроткого». Менее вероятная, но возможная версия: искажённое греческое «ημερήσιος» (имерисиос) — «дневной», «ежедневный», что могло быть прозвищем подёнщика или работника, занятого световым днём.

География фамилии подтверждает греческую версию. Имерцаки встречается в основном на юге России и в Краснодарском крае, куда в XIX — начале XX века переселялись греки из Османской империи, а также понтийские греки из Трапезунда. Встречаются единичные носители на Украине, в частности в Одесской области — регионе, где исторически сильна греческая диаспора и молдавское влияние.

Сословной принадлежности у фамилии Имерцаки, скорее всего, не было — греческие переселенцы в Российской империи часто записывались в мещанское или купеческое сословие, реже — в крестьянское. Фамилия не даёт указаний на дворянство или духовенство. По форме это типичная патронимическая фамилия (по отцу), застывшая в греческом уменьшительном суффиксе.

Родственными по модели образования можно считать фамилии Мавромаки, Пападаки, Карамаки — все они греческого происхождения с тем же суффиксом. Если сравнивать с русскими фамилиями, то по смыслу «Имерцаки» близка к фамилии Кротов (от «кроткий»), но с иной культурной окраской.