Фамилия Имишкеева — редкий пример тюркского наследия, закрепившегося в русской фамильной системе. Её основа — мужское имя Имишкей (или Имишке), которое, скорее всего, восходит к тюркскому слову «имиш» — «сосок» или «вымя». В ономастике это не физиологическая грубость, а ласкательное прозвище для младшего, «молочного» ребёнка, любимчика семьи. Подобные имена-обереги были распространены у башкир, татар и казахов: считалось, что «некрасивое» имя оттолкнёт злых духов от слабого младенца.

Суффикс -еев (фонетический вариант -ев) указывает на притяжательную форму: Имишкеев — «сын Имишкея». Женское окончание -а в Имишкеева — не признак исходной фамилии, а результат паспортной русификации: в XIX–XX веках женские варианты тюркских фамилий получили стандартное русское окончание -а. В дореволюционных метриках мужчина мог писаться как Имишкеев, а его дочь — Имишкеева, но после закрепления фамилии форма с -а стала общей для всех женщин рода.

Географически фамилия привязана к южному Уралу и Зауралью. Основной ареал — Башкортостан и Челябинская область, где до сих пор встречаются носители среди башкир и мишарей. Встречается вариант Имишеев — с утратой -к- в основе, что типично для устной речи: «Имишкей» в быту могли произносить как «Имишей». Оба варианта восходят к одному корню.

Сословно предки Имишкеевых, скорее всего, относились к башкирским вотчинникам или тептярам (сословие безземельных арендаторов). В отличие от татарской знати, башкирские фамилии на -ев/-ин редко указывали на дворянство — они фиксировали имя отца в момент переписи. Так что титула за фамилией нет, но есть чёткая привязка к роду, где младшего сына когда-то ласково называли «сосунком».