Фамилия Инденбаум — яркий пример немецкой фамилии, закрепившейся в России. Её основа — два корня: «инден» (Inden) и «баум» (Baum). «Баум» переводится как «дерево». С первой частью сложнее: скорее всего, это архаичная форма предлога «in den» (в), слившаяся с артиклем. Вместе словосочетание «in den Baum» означало «в дереве» — такое прозвище могли дать человеку, жившему в дупле, в лесной сторожке или у заметного дерева.

Другая версия, менее вероятная, возводит первую часть к искажённому «Lind» (липа). Тогда Инденбаум — «липовое дерево», но в немецкой ономастике фамилии с корнем Linde встречаются в форме Lindenbaum, без перехода «l» в «i».

Модель образования типична для немецких фамилий-прозвищ: существительное с предлогом, которое со временем срослось в одно слово. Суффикса, как в русских фамилиях на -ов или -ин, здесь нет — это чистая основа, что указывает на позднее закрепление фамилии (XVII–XVIII века), когда сложные прозвища уже не переделывали под славянские модели.

В России фамилия Инденбаум встречается преимущественно у потомков немецких колонистов, приглашённых Екатериной II. Географически — Поволжье, Западная Сибирь, а также Петербург и Москва, куда немцы переезжали в XIX веке. Предки носителя фамилии могли быть крестьянами или ремесленниками, получившими прозвище по месту жительства, а не по профессии.