Фамилия Иокубаукас звучит непривычно для уха русского человека, но для литовца или жемайта в ней нет ничего странного. Это классическая литовская фамилия, образованная по продуктивной модели с суффиксом -аукас (-aukas). Если разобрать её по косточкам, мы увидим корень «Иокуб-», который является литовской фонетической адаптацией библейского имени Иаков (Jacob). В литовском языке имя Иаков звучит как Jokūbas, а в просторечии или в диалектах — Иокубас. Суффикс -аукас в литовской антропонимии выполнял две функции: он мог указывать на сына (патроним, то есть «сын Иокубаса») или на человека, имеющего отношение к обладателю имени, часто с уменьшительным или прозвищным оттенком.

Таким образом, Иокубаукас — это типичный литовский патроним, который буквально означал «потомок Якубаса» или «маленький Якубас». В русском языке такие фамилии обычно не склоняются, сохраняя форму мужского рода. В самой Литве фамилии на -аукас распространены в основном в этнографических регионах Аукштайтии и Жемайтии, хотя встречаются по всей стране. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в XVIII-XIX веках, литовские фамилии на -аукас часто фиксировались позже, в период литовского национального возрождения и после отмены крепостного права.

Интересно, что в польской и белорусской традиции то же самое имя Иаков дало фамилии Якубовский, Якубеня, Якубович. Иокубаукас — это «литовский ответ» на эти фамилии, но с другим суффиксом. Носитель такой фамилии, скорее всего, происходил из крестьянского или мещанского сословия Литвы, где патронимы на -аукас были особенно популярны в XIX веке. Встречаются также варианты написания через «J» (Jokubauskas), что соответствует литовской орфографии. В России и странах бывшего СССР фамилия могла искажаться при записи в паспорт, поэтому современные Иокубаукасы могут быть потомками литовцев, переселившихся в Сибирь, на Дальний Восток или в Казахстан в ходе столыпинской аграрной реформы или депортаций.