Фамилия Ионишканс — редкий случай, когда форма указывает на происхождение точнее, чем корень. Окончание -с прямо говорит, что перед нами латышская или, реже, литовская фамилия. В славянских языках такого суффикса нет, а в балтийских он стандартен для фамилий мужского рода (ср. латышские Берзиньш, Калныньш, литовские Сабонис, Ятконис). Так что носитель фамилии Ионишканс — почти наверняка потомок выходцев из Латвии или Литвы.

Основа Ионишк- восходит к личному имени Иона (древнееврейское йона — «голубь»). В православной и католической традиции это имя известно благодаря библейскому пророку Ионе. Однако в балтийском регионе имя могло закрепиться и через польское или немецкое влияние, где форма Иона (Jonas) была распространена. Таким образом, Ионишканс означает «сын Ионы» или «потомок Ионы».

Особенность фамилии — в её редкой модели. Если бы она была литовской, ожидался бы суффикс -онис (вроде Ионайтис). Латышский вариант, скорее всего, использует уменьшительный или патронимический суффикс -ишк- (ср. латышские фамилии на -iškis), который в русской передаче превратился в Ионишканс. Это указывает на то, что фамилия сформировалась не в центральной Латвии, а, возможно, в восточных регионах, где сильнее было славянское влияние на балтийскую речь.

Встречается фамилия преимущественно в Латвии и среди латышской диаспоры. В России она крайне редка и, скорее всего, принадлежит потомкам латышей, переселившихся в XIX — начале XX века (например, в Сибирь или на Дальний Восток). Сословной привязки нет: среди латышских крестьян и городских ремесленников фамилии на -с были обычны для всех слоёв, кроме высшей аристократии.

Если искать аналоги, можно вспомнить фамилии Ионин (русский вариант от того же имени) или Йонсон (шведский). Но Ионишканс стоит особняком — это балтийская ветвь того же библейского корня, сохранившая уникальную грамматическую форму.