Фамилия Иойкан — редкая, и её происхождение лежит не в славянской, а в еврейской ономастике. Основа фамилии — мужское библейское имя Иой (вариант Иоя). В Танахе так звали нескольких персонажей, например, отца пророка Амоса. К имени добавили суффикс -ан, характерный для еврейских фамилий восточноевропейского ареала (сравните: Лейбман, Берман, Гиршан). Этот суффикс часто указывал на принадлежность или родство: «Иойкан» буквально значит «сын Иоя» или «человек, связанный с Иоем».

Географически фамилия тяготеет к территории бывшей Речи Посполитой, особенно к современным Беларуси и Литве. В этих краях в XVIII–XIX веках у еврейского населения активно закреплялись фамилии по имени отца или деда с добавлением уменьшительно-родственных суффиксов. Вариант Иойкан — это ашкеназская модель, где не было отчества в русском понимании, а было прозвание по имени предка.

Написание фамилии устойчивое, но встречаются редкие варианты через «а» — Иайкан, что связано с особенностями произношения в разных диалектах идиша. В России и Украине фамилия практически не фиксируется: перепись 1897 года показывает единичные случаи в Витебской и Могилёвской губерниях.

Смысл фамилии прозрачен: она не описывает профессию или внешность, а служит маркером родовой памяти. Носитель фамилии Иойкан — потомок человека, которого звали Иой. В этом её отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён: здесь нет патронимического суффикса -ович, а есть прямой именной суффикс, что типично для еврейской традиции.

Сегодня фамилия остаётся малочисленной. Её обладатели живут в основном в Израиле, США и странах бывшего СССР. В России она почти не встречается, что делает её уникальной для генеалогического поиска.