Фамилия Исамбетова — редкий пример, где на стыке тюркского и русского языков родилась форма, сохранившая почти без изменений звучание исходного имени. Основа здесь — мужское имя Исамбет, которое в тюркской ономастике сложили из двух частей: «Иса» (арабская форма имени Иисус, почитаемого в исламе как пророк) и «бет» (от тюркского «бай» — богатый, господин, либо «бек» — князь, правитель). Получается «господин Иса» или «богатый, как Иса». Такие двусоставные имена с религиозным компонентом и титулом характерны для народов Поволжья и Приуралья — башкир, татар, казахов.

Суффикс «-ова» в конце — чисто русский показатель принадлежности, который добавили при адаптации фамилии в паспортную систему Российской империи. По модели «Исамбетов» (чей? — сын Исамбета) образовали мужской вариант, а «Исамбетова» — женская форма по той же схеме. Это значит, что предок носительницы фамилии по мужской линии носил имя Исамбет. Фамилия не прошла через сложные морфологические переделки: её не укорачивали, не добавляли уменьшительных суффиксов, что говорит о поздней фиксации — скорее всего, в конце XIX — начале XX века, когда крестьянам и сельским жителям массово присваивали фамилии по отцу.

Географически фамилия тяготеет к Башкортостану и Оренбургской области, реже встречается у татар. Встречаемость крайне низкая — это не массовая фамилия, а локальная, что делает её хорошим маркером родового гнезда. Если искать однокоренные варианты, то «Исамбетов» (без «а» на конце) — мужская форма, а также «Исамбаев» или «Исамбатов» — результат смешения с другим тюркским корнем «бай». В отличие от них, «Исамбетова» чётко держится за исходную форму «бет».

С точки зрения социального контекста, носители такой фамилии — потомки, скорее всего, не знати, а свободных общинников или башкир-вотчинников, у которых имя отца становилось фамилией без дополнительных сословных приставок. Никакой княжеской или дворянской окраски в суффиксе нет, это чистая патронимия.