Фамилия Исангильдина женского рода, а её мужская форма — Исангильдин. В основе фамилии лежит тюркско-татарское мужское имя Исангильде. Имя это составное: первая часть «исан» восходит к персидскому слову со значением «здоровый, благополучный», вторая «гильде» — тюркский глагольный компонент, означающий «родился». Полный смысл имени — «родился здоровым и благополучным ребёнком». Родители, давая такое имя, вкладывали в него пожелание крепкого здоровья и счастливой судьбы новорождённому.

Фамилия образована по стандартной для русского языка модели: к основе имени Исангильд- добавлен суффикс -ин и окончание -а (для женщин). Суффикс -ин в русских фамилиях традиционно указывает на принадлежность: «чей?» — сын или дочь Исангильды. Это типичный способ русификации тюркских имён в Поволжье и Приуралье, где веками жили татары и башкиры. Благодаря суффиксу -ин фамилия Исангильдина легко вписалась в русскую фамильную систему, сохранив при этом исконную основу.

Процесс закрепления фамилий у татар и башкир был долгим и завершился в основном к концу XIX — началу XX века. Окончательно говорить о точном месте и времени возникновения конкретного рода Исангильдиных можно только после углублённых генеалогических изысканий. Однако география фамилии сегодня подсказывает её корни: большинство носителей сосредоточено в Башкортостане, Татарстане и соседних регионах Урала. Это подтверждает, что предки современных Исангильдиных жили на стыке тюркской и русской культур, где имя Исангильде было распространённым и перешло в наследственную фамилию.

Стоит заметить, что фамилия Исангильдина сравнительно редкая. Встречаются и однокоренные варианты: Исангильдеев, Исангильдинов — они образованы от того же имени, но с помощью других суффиксов. Такое разнообразие — обычное дело в зоне активных языковых контактов, где одно имя могло дать начало нескольким фамилиям.