Фамилия Ищиков — нечастый случай, когда корень слова до сих пор живёт в языке, но в совсем другом значении. В основе лежит глагол «искать», а точнее — его старая, ныне почти забытая форма «искать» в смысле «разыскивать, промышлять, добывать». Однако напрямую от глагола фамилию не образовали: между ними стоит прозвище.

Прозвище Ищик в русских говорах могло относиться к человеку по роду занятий. В северных и сибирских диалектах «ищиком» называли старателя, золотоискателя, человека, который живёт поиском руды или ценного сырья. В других областях так могли прозвать сыщика, следователя или просто дотошного, въедливого человека, который вечно что-то вынюхивает и разузнаёт. В любом случае прозвище было профессиональным или характеризующим, а не ласкательным.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: прозвище на -ик (Ищик) плюс притяжательный суффикс -ов. Ищиков буквально означало «сын Ищика» или «принадлежащий Ищику». Суффикс -ик в прозвищах часто указывал на носителя действия (ср. Лётчик, Носик), но здесь он выполняет скорее словообразовательную роль: от глагольной основы «иск-» получилось имя деятеля.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, но нигде не образует плотных гнёзд. Нет оснований связывать её с дворянскими родами — скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, закреплённая в XVIII–XIX веках. Интересно, что при всей прозрачности корня фамилия не получила массового распространения: вероятно, прозвище Ищик было локальным и не стало общеупотребительным именем.