Фамилия Ишимбаева — яркий пример тюркского наследия в русской ономастике. Она происходит от мужского имени Ишимбай, которое складывается из двух основ. Первая часть, «ишим», восходит к слову «иш» — «ребенок, семья» — с притяжательным суффиксом -им-, что буквально означает «мой ребенок» или «моя семья». Вторая основа — «бай», в древнетюркском языке обозначавшая «богатый», «могущественный», «господин».

Соединяясь, эти части дают имя со значением «принадлежащий богатой семье» или «дитя богатого рода». Родители, давая сыну имя Ишимбай, вкладывали в него пожелание достатка, благополучия и высокого положения в обществе, а также надежду, что ребенок вырастет достойным мусульманином. Суффикс -ев в фамилии — типичный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «Ишимбаев» означает «сын Ишимбая».

Интересно, что фамилия Ишимбаева — женская форма, а мужской вариант — Ишимбаев. По модели образования она близка к таким фамилиям, как Ишмухаметов, Ишбулатов, где первая часть «иш» также указывает на родственную связь. Фамилия распространена преимущественно среди башкир и татар, что неудивительно: топоним Ишимбай хорошо известен как название города в Башкортостане, основанного в 1932 году. Однако фамилия старше города: она фиксировалась в метрических книгах и ревизских сказках еще в XIX веке, в частности в Оренбургской и Уфимской губерниях. Таким образом, носители фамилии Ишимбаева могут проследить свои корни в среде тюркских народов Поволжья и Приуралья, где имя Ишимбай было распространено задолго до появления одноименного города.