Фамилия Ишхабинов — редкая и с ярко выраженным нерусским корнем. Её основа не имеет ничего общего с русскими прозвищами или мирскими именами: она восходит к личному имени Ишхаби́н. Это имя, в свою очередь, — производное от тюркского слова «иш» (работа, дело) и арабского «хабиб» (любимый, друг). Буквально Ишхабин можно перевести как «любимый в делах» или «дорогой товарищ по работе». Такие составные имена были характерны для народов Кавказа и Поволжья, где смешивались тюркские и арабские языковые пласты.

Самый вероятный ареал происхождения фамилии — Дагестан, Чечня или Ингушетия. В этих регионах, особенно у кумыков и чеченцев, распространены фамилии на -ов, образованные от арабо-тюркских имён. Суффикс -ов указывает на русскую канцелярскую традицию оформления фамилий в XIX — начале XX века, когда горцам при переписях и призыве на военную службу массово «обрусивали» родовые имена. Таким образом, Ишхабинов — это «сын Ишхабина», то есть потомок человека, носившего это составное имя.

Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами Северного Кавказа. В центральных регионах России она единична и, скорее всего, принадлежит потомкам переселенцев или студентов, уехавших учиться. В самой республике написание может варьироваться: встречаются варианты Ишхабиев, Ишхабов, но форма на -ин (Ишхабин) тоже возможна, если исходное имя осознавалось как «свой», а не как заимствованное. Учитывая редкость, носители фамилии, вероятно, принадлежат к одному роду или нескольким близким тухумам (родовым группам). Точных данных о сословной принадлежности предков нет, но в горских обществах такие фамилии могли носить как уздени (свободные общинники), так и представители духовенства, если имя было связано с религиозным контекстом (хабиб — один из эпитетов пророка Мухаммеда).