Фамилия Ишмекеева — женская форма мужской фамилии Ишмекеев, и её разбор лучше всего начать с корня. Основа здесь — тюркское имя или прозвище Ишмекей. Скорее всего, оно восходит к глагольной форме «ишмек» (в разных тюркских языках — «пить»), но в имени собственном значение не буквальное. Скорее, это часть сложносоставного имени: «иш» может означать «дело, работа», а «мекей» — уменьшительно-ласкательный аффикс. В ономастике тюркских народов Поволжья и Урала такие имена не редкость: Ишмекей — «работящий», «деловой человек».

Суффикс -ев указывает на русскую модель патронимической фамилии: Ишмекеев буквально значит «сын Ишмекея». Фамилия характерна для татар, башкир и других тюркоязычных народов, живших в зоне активного контакта с русским языком. Примечательно, что в окончании нет типичного татарского -ов (Ишмекеев, а не Ишмекейов) — это говорит о поздней русификации, когда исходное имя адаптировали под русскую грамматику.

Географически фамилия тяготеет к Башкортостану, Татарстану и Оренбургской области. В метрических книгах XIX века Ишмекеевы встречаются среди тептярей и башкир-вотчинников — сословий, плативших ясак и занимавшихся земледелием или скотоводством. Встречается и вариант Ишмекей, без русского суффикса, но он редок.

Спорных версий у фамилии почти нет: тюркское происхождение очевидно. Иногда корень путают с «ишмек» (пить), что порождает догадки о прозвище «пьяница», но это маловероятно: в тюркской антропонимике такие прямые негативные характеристики редко становились основой фамилий. Куда правдоподобнее связь с понятием «работа, дело» — имя должно было подчёркивать положительное качество человека.

Известных носителей с этой фамилией в открытых источниках немного, что типично для редких локальных фамилий. Если вы встретили Ишмекееву, её предки почти наверняка жили на южном Урале или в Приуралье, а сама фамилия сохранила память о прозвище предка, который в своём кругу слыл трудолюбивым или занятым человеком.