Фамилия Ишора звучит непривычно для русского уха, но её происхождение не такое загадочное, как может показаться. В основе фамилии лежит название реки Ижора (в старых источниках — Ижора, Ижера), которая протекает в Ленинградской области и впадает в Неву. Слово «ижора» также обозначало прибалтийско-финский народ, издавна живший по берегам этой реки. Таким образом, фамилия Ишора — это этноним, то есть прозвище, данное человеку по национальной принадлежности: «ижора» или «выходец из ижорских земель».

Форма фамилии — без суффикса, что сразу выделяет её на фоне типичных русских фамилий на -ов, -ин или -ский. Такая «голая» основа характерна для прозвищ, которые закрепились в качестве фамилий в украинской, белорусской и южнорусской традициях. Встречаются варианты написания: Ижора, Ижера, а также Ижорин, Ижорский. Фамилия Ишора могла возникнуть в результате диалектного произношения, когда «ж» перешло в «ш» (ср. «ишак» из «ижак»), или из-за неграмотной записи в документах.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России и Прибалтике, где ижоры жили компактно. В XIX веке носители фамилии Ишора встречались в Петербургской, Новгородской и Псковской губерниях. Предок-носитель такой фамилии мог быть либо самим представителем этого малочисленного народа, либо русским крестьянином или мещанином, который получил прозвище за то, что жил среди ижор или торговал с ними.

В ономастике эту фамилию иногда путают с фамилией Ишора, образованной от гидронима Ишора (река в бассейне Оки), но связь с рекой Ижорой и народом ижора всё же основная и подтверждается историческими записями. Фамилия редкая, но не исчезнувшая — её носители живут в России и странах бывшего СССР, сохраняя память о древнем финно-угорском народе.