Фамилия Исхамянов — нечастая, но её устройство прозрачно для того, кто знаком с тюркскими именниками. В её основе лежит имя Исхамян, которое, в свою очередь, восходит к арабскому имени Исхак (библейский Исаак, пророк в исламе). Тюркский суффикс -ян (как в фамилиях Исхаков, Исхаков) здесь выполняет роль патронимического показателя: Исхамян означает «сын Исхака» или «потомок Исхака». Таким образом, фамилия Исхамянов — это русифицированная форма тюркского отчества: к основе Исхамян прибавили русский суффикс принадлежности -ов, что типично для фамилий тюркских народов, оказавшихся в составе Российской империи.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически сильны татарские и башкирские общины: Татарстан, Башкортостан, а также Оренбургская, Челябинская, Свердловская области. Встречается она и у казанских татар, и у мишарей, и у башкир. Судя по модели образования, фамилия не древняя — она возникла не раньше середины XIX века, когда у тюркских народов начали массово закрепляться наследственные фамилии по русскому образцу. До этого человека могли звать просто Исхамян углы (сын Исхака) или Исхамян бабай (дед Исхамян).

Интересная деталь: написание через «я» (Исхамян-ов) может указывать на диалектное произношение. В некоторых тюркских говорах конечный звук основы смягчается, и имя Исхак в патронимической форме звучит как Исхәк-ян, что на письме передаётся как «Исхамян». Если бы фамилия образовывалась от литературной формы, она выглядела бы как Исхаков или Исханов. Но вариант Исхамянов закрепился именно в народной, бытовой речи. Это редкий случай, когда фамилия сохранила живую фонетику диалекта, а не книжную норму.

Второй, менее вероятный, вариант происхождения — от личного имени Исхам (с конечным «м»). Это имя могло быть вариантом имени Исхак или самостоятельным образованием от арабского корня «исхам» (вклад, доля). Тогда фамилия означала бы «сын Исхама». Однако в ономастических справочниках имя Исхам встречается редко, так что версия с патронимом от Исхака выглядит убедительнее.