Фамилия Исмагомбетов — яркий пример того, как тюркская и арабская традиции соединились в русском именослове. Её основа — мужское имя Исмагомбет, которое состоит из двух частей. Первая — «Исмаг» — это диалектный вариант имени Исмаил (в русской библейской традиции Измаил), что в переводе с древнееврейского означает «Бог услышит». Вторая часть — «гембет» — восходит к тюркскому «бек» (господин, князь). В казахском и башкирском языках часто встречается форма «бет» или «бек» в сложных именах, а начальное «г» могло появиться как связка для благозвучия. Таким образом, Исмагомбет — это «князь (или господин) Исмаил», то есть имя, дававшееся ребёнку с пожеланием знатного положения и божественного покровительства.

Русский суффикс -ов в конце фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Исмагомбетов, то есть сын или потомок Исмагомбета. Такая модель образования типична для фамилий, которые оформились у тюркских народов под влиянием русской административной системы в XIX — начале XX века. В отличие от более древних русских фамилий на -ов, здесь суффикс приращивается прямо к полному имени, без усечения или изменения корня.

Географически фамилия Исмагомбетов чаще всего встречается среди башкир, татар и казахов. Башкирский вариант имени мог звучать как Исмагилбет или Исмагилбек, а в документах его записывали на слух — так и появилось написание через «о». В казахской среде более распространена форма Исмагулов или Исмагамбетов, но вариант с «ом» в середине тоже фиксируется, особенно в Западном Казахстане и Оренбургской области.

Интересная деталь: в некоторых переписях XIX века фамилию могли записать как Исмагометов, путая её с производными от имени Магомед (Мухаммед). Но Исмагомбетов — это именно имя Исмаил в сочетании с титулом «бек», а не вариация на тему пророка. Эта путаница показывает, как в многоязычной среде переписчики не всегда различали близкие по звучанию, но разные по смыслу имена.

Носители фамилии — потомки людей, носивших почётное имя-пожелание. Скорее всего, предки были не рядовыми кочевниками, а людьми, имевшими отношение к старшинству в роду или к военной знати, поскольку имя содержало компонент «бек». Впрочем, к моменту закрепления фамилий этот титул мог уже быть чисто номинальным, передаваясь как часть личного имени без реального социального статуса.