Фамилия Иту — редкий случай, когда фамилия образована напрямую от прозвища без типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Основа здесь — прозвище Ит. Если отталкиваться от румынского глагола iti («смотреть украдкой», «выглядывать», «появляться»), то прозвище могло описывать характер: скромного, застенчивого человека, который как будто всё время прячется или выглядывает из-за угла. Но есть и другая версия: Ит — прозвище охотника, того, кто умеет выслеживать, появляться незаметно. Оба значения укладываются в логику бытовых прозвищ, которые давали по самой заметной черте поведения.

Сама фамилия Иту, скорее всего, закрепилась не в центральной России, а на юго-западных территориях, где было сильное румынское или молдавское влияние. Форма на -у (как в фамилиях Кожух, Барабуля) характерна для украинской и молдавской ономастики: это либо застывшая форма родительного падежа, либо усечённая основа без суффикса. То есть фамилия могла означать «(сын) Ита» или просто «Ит».

Сравните с однокоренными фамилиями Итов, Иткин — они встречаются чаще, но образованы по русской модели. Иту стоит особняком: она короткая, без добавочных суффиксов, что указывает на более раннюю фиксацию прозвища или на иную языковую среду. В словарях С. Веселовского и Б. Унбегауна эта фамилия не зафиксирована, что подтверждает её локальный характер и малую распространённость.