Фамилия Изаекова, при всей своей кажущейся необычности, укладывается в несколько типичных для русской ономастики моделей. Её основа — Изаек — скорее всего, является вариантом тюркского или арабского имени, адаптированного в русской среде. Разберёмся по порядку.

С точки зрения словообразования, фамилия женская, образована от мужской Изаеков по стандартной модели прибавлением суффикса -а. Мужская форма, в свою очередь, построена с помощью патронимического суффикса -ов, что указывает на происхождение от отца или основателя рода по имени Изаек. Само имя Изаек — это, вероятно, русифицированная форма тюркского имени, восходящего к арабскому «Исхак» (библейский Исаак). В тюркских языках, особенно в татарском, башкирском, казахском, звук «с» часто переходит в «з», а конечное «ак» могло редуцироваться до «ек» или «як». Таким образом, Изаек — это диалектный или просторечный вариант имени Исхак, означающего «смеющийся» или «радость» (в библейской традиции — «смех Божий»).

Возможна и вторая, менее вероятная версия. Изаек могло быть прозвищем, образованным от тюркского слова «из» (след) или «изе» (следопыт, идущий по следу) с добавлением уменьшительного суффикса. В этом случае прозвище мог получить человек, который хорошо ориентировался на местности, был проводником или следопытом. Однако первая версия — от имени Исхак — выглядит предпочтительнее, так как фамилии на -ов от арабских и тюркских имён в Поволжье и на Урале встречаются массово.

Географически фамилия Изаекова, скорее всего, имеет корни в регионах с сильным татарским или башкирским влиянием: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также среди казанских или мишарских татар. В XIX веке многие татары, принимая православие или просто фиксируя фамилии по русскому образцу, русифицировали свои имена, и Изаек — характерный пример такой адаптации. При этом фамилия остаётся редкой, что говорит о локальном бытовании, возможно, в пределах одного села или небольшой группы родов.

В современной России фамилия Изаекова встречается, но не часто. Её носители — потомки тех, кто когда-то носил имя Изаек, и в их родословной, скорее всего, есть тюркские или мусульманские корни. Фамилия не даёт прямых указаний на сословие — её могли носить как крестьяне, так и служилые татары, позже вошедшие в состав купечества или мещанства.