Фамилия Изайски — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но происхождение при этом неочевидно. Типологически это фамилия на -ски, что сразу указывает на польскую или западнорусскую (белорусскую, украинскую) модель образования. В польской ономастике суффикс -ski был показателем шляхетского происхождения, но со временем стал просто фамильным форматом, распространённым и среди крестьян. В русской традиции фамилии на -ский часто давались по названию населённого пункта или по церковному прозвищу.

Основа «Изай» — это, скорее всего, искажённая или диалектная форма библейского имени Исайя (Иешаягу). В польском языке имя Исайя звучит как Izajasz, отсюда могла возникнуть форма Izajski. Однако в восточнославянской среде имя бытовало в народных вариантах — Исай, Изай, Озай. Фамилия Изайски могла образоваться от прозвища Изай, которое давали человеку, родившемуся или крещённому в день памяти пророка Исайи, либо просто носившему это имя.

Вторая, менее вероятная версия — географическая. В Польше и на территории бывшей Речи Посполитой существовали топонимы вроде Изай (Izaje), но они крайне редки и не фиксируются в крупных справочниках. Если фамилия происходит от названия деревни, то её носитель — выходец из такого места.

Фамилия Изайски встречается спорадически, в основном в западных регионах России и в Беларуси. В дореволюционных метрических книгах её можно найти среди мещан и крестьян, а не только дворян, что говорит о позднейшем распространении модели на -ски в среде непривилегированных сословий. Поскольку фамилия нечастотная, её носители, скорее всего, принадлежат к одному или нескольким родственным гнёздам, разошедшимся по разным городам.