Фамилия Ижунцова — женская форма фамилии Ижунцов, и её разбор стоит начать с неочевидного: суффикса -цов. В русских фамилиях обычны суффиксы -ов/-ев и -ин, а -цов встречается реже и указывает на особый путь образования. Чаще всего он возникает, когда основа оканчивается на -ц: например, от прозвища или имени Ижунец. Суффикс -ов (в виде -цов) присоединялся к основе, давая значение «сын Ижунца» или «принадлежащий Ижунцу».

Сама основа — Ижун — вызывает вопросы. В русской ономастике нет распространённого имени или прозвища Ижун. Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с географическим названием. В бассейне реки Ижора (приток Невы) и в Прибалтике встречаются топонимы с корнем Иж-: река Иж, село Ижма, Ижевск. Жителя такой местности могли прозвать Ижунцом — «выходцем с Ижа» или «человеком с реки Иж». Суффикс -ун в прозвищах (как в «говорун», «бегун») мог указывать на характерный признак или занятие, но здесь он, скорее, служит для образования названия жителя.

Менее убедительна, но возможна связь с диалектным словом «ижа» — в некоторых говорах так называли мелкую рыбу или, реже, сварливого человека. Однако для фамилии эта версия слабее: прозвище Ижа могло бы дать фамилию Ижин или Ижов, но не Ижунцов.

Таким образом, носитель фамилии Ижунцов, скорее всего, потомок человека, который происходил из местности с корнем Иж- (возможно, с берегов Ижоры или Ижа) и получил прозвище по месту выхода. Фамилия редкая, и её география, по данным открытых источников, тяготеет к северо-западу России — Ленинградской, Псковской областям, что косвенно подтверждает версию о прибалтийско-финском или ижорском следе. Суффикс -цов в данном случае — не просто грамматическая деталь, а маркер того, что фамилия образована не от имени, а от прозвища на -ец.