Фамилия Качинскас — один из характерных примеров того, как литовская модель образования фамилий расходится с русской. В ней нет привычного суффикса -ов или -ин; окончание -ас указывает на мужской род в литовском языке и принадлежность к определённой группе носителей. Перед нами типичная литовская фамилия, которая в русском контексте остаётся практически без изменений, лишь теряя литовское окончание в женском варианте (Качинскене для замужней женщины, Качинскайте для незамужней).

Основа фамилии — корень «Качин-». Он восходит к литовскому слову «kakė» или «kakti», что значит «цапля» или «аист». В литовской ономастике это нередкий случай: фамилии, образованные от названий птиц, часто давали по внешним признакам человека (длинноногий, с длинной шеей) или по его поведению (любитель постоять на одном месте, наблюдатель). Суффикс -ин- (возможно, с влиянием польского -иньский) мог указывать на уменьшительность или принадлежность: «Качинскас» можно перевести как «маленький цапля» или «сын человека по прозвищу Качя».

Географически фамилия тяготеет к северо-восточной части Литвы, особенно к Жемайтии и Аукштайтии, где распространены фамилии на -скас. В Российской империи такие фамилии фиксировали у литовцев, живших в Ковенской, Виленской и Сувалкской губерниях. После Первой мировой войны и в советское время часть носителей могла мигрировать в Латвию, Польшу и на запад России.

В отличие от многих фамилий с прозрачной славянской этимологией, Качинскас не имеет отношения к русскому слову «качка» или «качать». Это чисто балтийское образование, и попытки вывести его из польского «kaczka» (утка) ошибочны: литовский корень «kak-» даёт именно цаплю, а не утку. Встречающееся в интернете мнение, что фамилия могла произойти от названия деревни Качине (Kаčinė) в Литве, не подтверждается историческими источниками — такая деревня не зафиксирована.

Социальный статус предков-носителей фамилии определить сложно. Литовские крестьяне часто получали фамилии по прозвищам от помещиков или писарей в XIX веке, после отмены крепостного права. Поэтому Качинскас — скорее всего, потомок крестьянина, который выделялся длинными ногами или привычкой носить длинную одежду, напоминавшую цаплю.