Фамилия Каипецкий хранит память о предке по имени Каип. Скорее всего, это фонетический вариант имени Гаип (или Гаиф), которое восходит к мусульманскому имени Гайфетдин. В переводе с арабского оно означает «милосердие, милость религии». Потомок человека по имени Каип со временем получил фамилию Каипецкий.

Фамилия образована по модели, типичной для украинских и польских земель: к основе Каип- добавился суффикс -ецк-, а затем окончание -ий. Суффикс -ецк- (в польском написании -ecki) указывал на принадлежность к определённой местности или роду. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, эта модель чаще встречается на западе и юго-западе исторической Руси. Поэтому географически фамилию стоит искать среди выходцев с территории современной Украины, Беларуси или юга России, где были сильны польские и украинские ономастические традиции.

Необычность фамилии в том, что корень Каип- не славянский, а тюркско-арабский. Это говорит о том, что предок носителя фамилии мог быть крещёным татарином, башкиром или выходцем из мусульманской среды, принявшим православие. Подобные случаи — не редкость: многие фамилии с основой на -аип-, -гаип- (Гаипов, Каипов) встречаются в Поволжье и на Урале. Однако суффикс -ецкий выдаёт не восточное, а западное происхождение фамилии — скорее всего, предок Каипецких был переселенцем или беженцем, сменившим регион.

Имя Каип могло быть и прозвищем, данным по внешности или характеру. В тюркских языках есть слово «каип» — «скрытый, таинственный» (от араб. غائب — «отсутствующий, невидимый»). Если это так, то прозвище мог получить человек замкнутый, нелюдимый или тот, кого долго не было дома. Но всё же версия с мусульманским именем Гайфетдин выглядит надёжнее: имена через Гаип → Каип давали осознанно, а прозвища такого рода встречаются реже.

Сведений о сословной принадлежности рода Каипецких нет. Фамилия не указывает прямо на дворянство или крестьянство: суффикс -ский мог носить как шляхтич, так и крестьянин, получивший фамилию по названию деревни. Документальных упоминаний о Каипецких в исторических источниках пока не обнаружено, что говорит о малочисленности и локальном бытовании фамилии.