Фамилия Какабокон — редкая, сложная и неоднозначная. Её форма сразу выбивается из привычной схемы русских фамилий: здесь нет типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -он наводит на мысль о западном, скорее всего, польском или украинском влиянии. В польском языке суффикс -он (-ą) часто встречается в причастиях и именах деятеля (например, biegacz — бегун), а в украинском — как результат фонетических изменений. Таким образом, Какабокон могло быть прозвищем, которое «ополячили» или «украинизировали» при записи в документы.

Сам корень фамилии — «какабо» — звучит не по-славянски. Вероятнее всего, это искажённое тюркское или кавказское слово. В языках народов Северного Кавказа, например в адыгейском или кабардинском, есть корни «кIакIуэ» (лёгкий, быстрый) или «кIэбэ» (короткий). При переходе в русскую речь и последующей записи через польское посредство «Какабокон» могло означать «быстроногий» или «коротышка». Менее вероятна, но возможна связь с грузинским словом «какабо» — так называют вид орла, и тогда прозвище могло указывать на зоркость или хищный нрав.

Исследователи фамилий, такие как Б. Унбегаун, отмечают, что фамилии с неясным корнем и нетипичным окончанием часто возникали в пограничных регионах Российской империи — на Кубани, в Ставрополье или в Запорожье. Носители фамилии Какабокон, скорее всего, были казаками или крестьянами, получившими прозвище от соседей-горцев. Сама фамилия — живое свидетельство языкового смешения на южных рубежах, где русский, польский и местные языки переплетались, оставляя такие неожиданные следы в антропонимии.