Фамилия Кальюнен — редкий для России случай финского или карельского происхождения. Её основа — личное имя Калью или Калья, которое является народной формой библейского имени Гавриил (в финской традиции — Kалью, Kalle). Суффикс -нен — типичный финский патронимический формант, буквально означающий «сын» или «человек из рода». Таким образом, Кальюнен — это «сын Калью» или «потомок Калью».

В русском контексте фамилия могла появиться несколькими путями. Первый — естественная миграция ингерманландских финнов или карелов в центральные губернии и на Урал в XVIII–XIX веках. Второй — русификация финских фамилий при записи в метрические книги: исходное финское написание могло быть Kälviäinen или Kalliainen, но в русской транскрипции закрепилось как Кальюнен. Третий вариант — происхождение от прозвища Калью, что в северных говорах могло означать «крепкий», «коренастый» человек (от финского kalle — «скала»).

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком среди типично русских фамилий на -ов/-ев или -ин. Суффикс -нен — один из самых распространённых в финской ономастике (сравните: Виртанен, Хейккинен, Лейнонен). В России носители фамилии Кальюнен чаще всего встречаются в Ленинградской области, Карелии и в регионах, куда переселяли финнов в советское время (например, в Вологодской области). Из-за репрессий 1930-х годов многие финские семьи меняли фамилии на русские, поэтому Кальюнен — не самая частая фамилия, но её носители сохранили память о финно-угорских корнях.

Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они были крестьянами или ремесленниками из приграничных с Финляндией районов. В дворянских списках Кальюнены не встречаются — это фамилия простого люда, что типично для финских патронимов.