Фамилия Калюшкины отталкивается от прозвища Калюшка, а то, в свою очередь, от слова «калюга». В белорусских, украинских и южнорусских говорах так называли лужу, мелкое озеро или просто яму, полную воды. Первый носитель прозвища мог жить в болотистой низине или на улице, которая после дождя превращалась в сплошное месиво. Но есть и другая версия: прозвище могли дать не по месту жительства, а по характеру — неопрятному человеку, который «ходит по калюгам» или сам похож на грязь.

Фамилия образована по стандартной русской модели: основа Калюшк- плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Калюшки). Такая схема типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Обратите внимание на суффикс -ушк-: он придаёт слову уменьшительно-пренебрежительный оттенок. То есть прямое прозвище «Калюга» звучало грубее, а «Калюшка» — чуть мягче, возможно, так дразнили подростка или невысокого мужчину.

В документах фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, очаг возникновения — западные или южные области России, где слово «калюга» было в ходу. В центральных и северных говорах для лужи использовали другие слова (лужа, мочажина, бакалда), поэтому там прозвище вряд ли бы появилось.

По сословной принадлежности однозначно сказать нечего: носителями могли быть и крестьяне, и однодворцы. Суффикс -ин в русских фамилиях чаще встречался у простых людей, чем у дворян, но это лишь статистическая тенденция, а не правило.

Фамилия не перепутана с однокоренными Калугин или Калюжный — у них разные суффиксы и география. Калюшкин стоит особняком именно из-за редкого уменьшительного форманта.