Фамилия Калюшкин образована от прозвища Калюшка. Его основа — слово «калюга», которое в белорусском, украинском языках и некоторых русских говорах означает «мелкое озеро, лужа, наполненная водой яма», а также «покрытое лужами место». Скорее всего, предок носителя этой фамилии жил в топкой, заболоченной местности, за что и получил такое прозвище. Впрочем, прозвище Калюшка могло указывать и на особенности характера — неаккуратность, неопрятность. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «сын Калюшки». Так потомок человека с этим прозвищем со временем стал Калюшкиным. Это типичная модель русских фамилий, образованных от прозвищ, распространённая в первую очередь в северных и центральных регионах России, где активно бытовали говоры с такой лексикой.