Фамилия Калюшины — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или арабская, прошедшая через русскую обработку. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Калюшин», то есть потомок человека по прозвищу Калюша. Само прозвище могло возникнуть от тюркского слова «калюш» (или «калыш»), означающего «остаток», «сдача», «излишек». В переносном смысле так могли назвать младшего, позднего ребёнка в семье или, наоборот, человека, который всегда оставался в долгу, «на сдачу».

Есть и другая, менее вероятная версия — связь с арабским именем Халиль (в значении «верный друг»), которое через тюркское посредничество могло превратиться в «Калюш». В этом случае фамилия восходит к крестильному имени, но не православного, а мусульманского круга, что говорит о возможных контактах предков с восточными соседями. Версия о происхождении от русского слова «калека» или «калякать» (болтать) фонетически менее убедительна: в них другой корень и ударение.

Географически фамилия Калюшины встречается нечасто, в основном в Поволжье и на Южном Урале — в зоне активного смешения русского и тюркского населения. Это косвенно подтверждает первую версию: предки Калюшиных могли быть выходцами из татарской или башкирской среды, принявшими православие и получившими фамилию по старому родовому прозвищу. В документах XIX века такая фамилия фиксируется среди государственных крестьян и мещан, то есть сословий, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений.

Однокоренные фамилии — Калюшный, Калюшев, Калюш — встречаются в украинской и польской традиции, но с другим суффиксом (-ев, -ный). Калюшины же — типично русская форма, закрепившаяся именно с суффиксом -ин, что подчёркивает: основатель рода был известен под прозвищем Калюша, а его дети пошли по отцу.