Фамилия Калютников — редкий пример отчества, образованного через суффикс -ников, а не через более привычные -ов или -ин. Эта словообразовательная модель указывает на происхождение от прозвища или профессии, оканчивающейся на -ник, в родительном падеже: «чей? — Калютников», то есть сын Калютика. В основе лежит имя или прозвище Калютник, которое, в свою очередь, восходит к старому русскому слову «калюта» (или «калюжка») — так в некоторых говорах называли лужу, болотце, грязь.

Скорее всего, прозвище Калюта или Калютник дали человеку, который жил у болотистой местности, часто пачкался или работал в сырости — например, рыбак, сапожник, гончар. В ономастике это типичный «топографический» случай: фамилия закрепляла за родом место жительства или характерный признак. Менее вероятно, но возможно, что «калюта» — это искажённое диалектное «каляка» (болтун) или «калита» (кошель, мешок), однако эти версии слабее: фонетика «калют-» уверенно тянет к значению «грязь, влажность».

Фамилия очень редкая. Встречается преимущественно в центральных и северных областях России (Вологодская, Костромская, Ярославская), где диалектное слово «калюта» было в ходу. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьянские и посадские записи с основой Калюта — например, в писцовых книгах Новгородской земли. Социально Калютниковы почти наверняка происходят из крестьян или ремесленников: дворянские роды с таким окончанием (-ников) в России не фиксировались.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Калютин, Калюжный, Калюжников — показывает, что все они связаны с тем же корнем «калюг-»/«калют-» (грязь, лужа). Но Калютников стоит особняком из-за суффикса -ников, который в русских фамилиях встречается реже, чем -ин или -ов. Это делает её не просто географическим маркером, а указателем на конкретную модель именования: не «сын Калюты», а «сын Калютика» (человека с прозвищем Калютник). Такая двойная суффиксация (Калют- + -ник + -ов) — верный признак того, что прозвище было устойчивым и передавалось в семье как второе имя ещё до закрепления фамилии.