Фамилия Кандекин — редкий случай в русском ономастиконе, где основа не очевидна на первый взгляд. В ней нет привычного корня, связанного с ремеслом или природой, и это заставляет копать глубже.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Кандекин — буквально «сын Кандеки» или «человек из рода Кандеки». Вопрос упирается в то, что такое «Кандека». Самое вероятное объяснение — это вариант крестильного имени Кандид (от латинского candidus — «белый, блестящий, чистый»). В просторечии имя Кандид могло превратиться в Кандека через чередование «и» и «е» под влиянием акающих говоров. Тогда Кандекин — аналог фамилии Кандидов, но в народной, «опрощенной» форме.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с тюркским словом «кандек» (ров, канава). В таком случае прозвище Кандека могли дать человеку, жившему у рва или занимавшемуся рытьём канав. Однако для фамилий на -ин тюркская основа встречается реже, чем адаптация христианского имени.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, где аканье и смягчение согласных были нормой. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного прозвища в конкретной деревне.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Кандеев, Кандин, Кандыков — все они могут восходить к тому же источнику (имя Кандид), но через разные диалектные искажения. Кандекин отличается суффиксом -ин, который в русских фамилиях чаще присоединялся к основам на -а, что косвенно подтверждает версию о прозвище или имени с конечным гласным.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или мещанским: фамилии на -ин от полных крестильных имён в этой среде давали реже, чем от уменьшительных форм. Кандекин — фамилия, образованная от обиходного, домашнего варианта имени, что типично для сельской местности, где официальное имя могли переделать до неузнаваемости.