Фамилия Канистратенко — редкий пример украинской фамилии, образованной от названия предмета, который стал прозвищем. В основе лежит слово «канистра» (ёмкость для жидкостей), а суффикс -енко указывает на украинское происхождение и типичную модель «сын такого-то» или «потомок такого-то». То есть Канистратенко — буквально «сын Канистрата», а Канистрат — это человек, которого прозвали Канистрой.

Почему предка могли прозвать Канистрой? Версий несколько. Самая прямая: человек торговал канистрами, изготавливал их или постоянно носил с собой — например, как бродячий торговец маслом, керосином или водой. В украинских сёлах XIX — начала XX века канистра была заметным бытовым предметом, и прозвище по нему могло закрепиться за человеком, который с ней не расставался. Менее вероятно, но возможно, что прозвище имело ироничный оттенок — так могли назвать полного или «надутого» человека, по ассоциации с формой ёмкости.

Суффикс -енко — самый распространённый фамильный формант в Восточной Украине. Он указывает, что фамилия сложилась не раньше XVII века, когда эта модель стала массовой среди казачества и крестьянства. Канистратенко — фамилия недворянская, скорее всего, запорожского или слобожанского происхождения, от человека простого сословия, чьё прозвище дали по занятию или внешности.

Аналогов в русских фамилиях практически нет: в России использовали суффиксы -ов/-ев, и фамилия звучала бы как Канистров или Канистрин. Украинский вариант сохранил исходное прозвище почти без изменений, что редкость: обычно основу усекали или переделывали. Канистратенко — один из тех случаев, когда бытовой предмет стал родовым именем и закрепился в потомстве без переосмысления.