Фамилия Канощенко звучит как типичная украинская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Модель образования — суффикс -енко, который в украинской ономастике XVI–XVII веков выполнял функцию отчества или указания на принадлежность к роду («сын такого-то» или «из семьи такого-то»). В современном понимании это «маленький Канош» или «потомок Каноша». Основа фамилии — прозвище Канош — требует отдельного разбора.

Самая вероятная версия связывает корень с украинским или польским словом «каноша» — так в некоторых западных регионах называли кожух, тулуп или овчинную шубу. Прозвище Канош мог получить либо человек, который шил или торговал такой одеждой (скорняк, овчинник), либо тот, кто постоянно носил тяжёлый тулуп и выделялся этим в быту. В среде казачества и крестьянства подобные прозвища по роду занятий были обычным делом.

Менее распространённая гипотеза выводит «каноша» из диалектного глагола «каношить» — возиться, копаться, делать что-то медленно. Тогда прозвище носило бы характер насмешки над медлительным или нерасторопным человеком. Однако для фамилий на -енко чаще берутся прозвища по профессии или внешнему признаку, а не по характеру, поэтому версия с тулупом выглядит убедительнее.

Географически фамилия Канощенко тяготеет к левобережной Украине — Черниговщине, Полтавщине, Сумщине. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках XIX века носители встречаются преимущественно среди казаков и государственных крестьян, то есть свободного сословия, а не крепостных. Это косвенно подтверждает, что фамилия возникла в казацкой среде, где прозвища закреплялись за родом и передавались по наследству.

В написании фамилии есть один нюанс: буква щ в суффиксе. Если бы основа была «Канош» и фамилия образовывалась по правилам русского языка, мы бы получили «Каношенко» (через «ш»). Украинская форма «Канощенко» указывает на чередование ш/щ — характерное для украинской фонетики явление, когда в производных формах шипящий смягчается. Это лишний раз доказывает, что фамилия сформировалась именно в украинской языковой среде.