Фамилия Капатилова — редкий пример, где географическая привязка оказывается едва ли не важнее, чем разбор корня. Если смотреть на суффикс, то перед нами типичная русская модель на -ов, но с необычным финалом «-илов» вместо привычного «-ов». Форма Капатилов (а женский вариант Капатилова) указывает на то, что основа — прозвище или мирское имя Капатило. Такие «глагольные» прозвища на -ило в старину часто давали человеку по его привычке или занятию: Говорило, Крутило, Ломало. Соответственно, Капатило могло означать «тот, кто капает» — в прямом смысле (например, неряшливый работник, проливающий жидкость) или в переносном (докучливый, «капающий на мозги» человек).

Однако есть и более конкретная версия, связанная с гидронимом. Речка Капатиловка протекает в Краснодарском крае, в районе города Горячий Ключ. Название речки, скорее всего, тюркского происхождения (от «капат» — крышка, закрытое место) или адыгейского, но фамилия могла возникнуть как раз от прозвища человека, жившего у этой реки или переселившегося с её берегов. В таком случае Капатилов — это не «капающий», а «выходец с Капатиловки». В пользу этой версии говорит то, что фамилия встречается в основном на юге России и Кубани, а не в центральных областях, где «капать» было бы более логичной основой.

Словообразовательный момент: суффикс -ов здесь присоединяется к основе на -ил-, что создаёт редкую для русских фамилий трёхсложную суффиксальную цепочку. Такие формы встречаются в основном у фамилий, образованных от прозвищ на -ило (например, Губилов, Крутилов). Если бы фамилия была от имени Капат (греческое Капатос или редкое славянское), мы бы получили Капатов. Наличие «-илов» однозначно указывает на прозвищную, а не на крестильную основу.

Что касается сословной принадлежности — фамилия недворянская, не встречается в родословных книгах. В XIX веке носители Капатиловы — это, скорее всего, государственные крестьяне или казаки, особенно если учитывать кубанский след. Точных дат и списков известных людей с такой фамилией нет, что только подтверждает её локальный и неаристократический характер.