Фамилия Капицкис — пример того, как географическое соседство и языковой контакт формируют русские фамилии. На первый взгляд, она звучит как типичная польская или белорусская фамилия с суффиксом -цкий, но окончание -ис выдает её литовское происхождение. Это не случайность: фамилия Капицкис — литуанизированная форма фамилии Капицкий, распространённой среди поляков и белорусов. В Литве, где исторически жило много славян, их фамилии нередко адаптировали под литовскую грамматику, добавляя окончание -ис (реже -ас, -ус). Так появились Капицкисы, Яблонскисы, Петраускасы.

Основа фамилии — Капиц- — восходит к прозвищу или имени Капица. В славянской ономастике слово «капица» имело несколько значений. В южнорусских и украинских говорах так называли шапку, колпак, а в переносном смысле — человека, который такую шапку носил. В диалектах Псковщины и Смоленщины «капица» означала «куча», «скирда» — прозвище могло относиться к крестьянину, работавшему с зерном. Есть и версия, что это уменьшительная форма от имени Прокопий (через «Копя» → «Капя» → «Капица»), но она менее убедительна, так как для русского языка типичнее было бы образование Капин или Капкин.

Суффикс -цкий указывает на дворянский или шляхетский способ образования фамилий в Речи Посполитой. Носитель фамилии Капицкий мог быть шляхтичем, владевшим поместьем Капицы или Капичи, либо выходцем из такого места. Однако в случае с Капицкисом сословная привязка размывается: литовские крестьяне, получая фамилии в XIX веке, нередко брали готовые польские модели, меняя лишь окончание. Поэтому предок современного Капицкиса с равной вероятностью мог быть и мелким землевладельцем, и крестьянином, которому фамилию дал писарь по названию соседней деревни или по прозвищу.

Сама фамилия Капицкис — яркий маркер литовско-славянского пограничья. Она встречается в основном в Литве и среди выходцев из неё, особенно в Вильнюсском крае и Жемайтии. В России эта фамилия редка и обычно указывает на литовские или белорусские корни семьи.