Фамилия Капочинский — пример типичной польско-украинской модели образования на -ский, указывающей на связь с географическим объектом. Основа фамилии — топоним Капочин (или Капачин), а точнее — название села, от которого пошло прозвище, а затем и фамилия. На Украине известны села Копачинцы (Винницкая область) и Копачивка (в разных регионах). Чередование о/а в корне (Копач → Капач → Капоч-) — не редкость для диалектной речи и при письменной фиксации фамилий, когда писарь записывал прозвище на слух, не сверяясь с единой нормой.

Если отбросить географическую версию, остаётся прозвище Капач (или Копач). В украинском языке «копач» означает «землекоп», «тот, кто копает». Прозвище могли дать человеку, занятому рытьём колодцев, канав, погребов или работающему в рудниках. Фамилии на -ский от прозвищ встречаются реже, чем от топонимов, но и такой вариант возможен: например, прозвище Копач превратилось в Копачинский, а затем через диалектное «аканье» — в Капочинский.

Суффикс -ский (в женском роде -ская) в этой фамилии указывает на дворянское или шляхетское происхождение её первых носителей. В Речи Посполитой и на западнорусских землях фамилии на -ский были характерны для мелкой шляхты, владевшей землёй в окрестностях села, от которого брала название. Если предки Капочинских действительно происходили из Копачинцев, то они могли быть местной шляхтой или однодворцами. Если же фамилия образована от прозвища — её носитель, скорее всего, был выходцем из крестьян или казаков, а суффикс -ский добавился позже, при получении паспорта или приписывании к сословию.

Однокоренные фамилии — Капачинский, Копачинский, Копач, Капач. Все они восходят к одному корню *kop- (копать) и различаются только диалектным произношением и региональными особенностями письма.