Фамилия Капроненко — украинская по модели образования, что сразу видно по суффиксу -енко. В украинской ономастике этот суффикс — самый массовый, он означает «сын» или «потомок» того, кто назван в корне. То есть Капроненко — буквально «сын Капрона» или «потомок Капрона». Основа фамилии — прозвище или некалендарное имя Капрон.

С корнем сложнее. В русских и украинских говорах слово «капрон» не фиксируется как самостоятельное имя или прозвище в словарях XIX — начала XX века. Самое очевидное объяснение — связь с материалом капрон, синтетическим волокном, которое появилось в СССР только в 1940-х годах. Но фамилия явно старше: массовое распространение фамилий на -енко приходится на XVI–XVII века. Значит, либо корень иной, либо это поздняя фамилия, образованная от прозвища по профессии или внешности.

Есть версия, что Капрон — вариант греческого имени Кефрон или Киприан, адаптированный в южнорусских и украинских диалектах. Греческие имена были распространены среди духовенства и купечества на юге Российской империи, особенно в Таврической губернии и Причерноморье. В таком случае фамилия означает «потомок Киприана» (Капрона). Правдоподобность этой версии подкрепляется тем, что фамилии с суффиксом -енко часто образовывались от крестильных имён, а не от редких прозвищ.

Вторая гипотеза — от слова «капор» (головной убор, капюшон) с диалектной заменой «р» на «н». В некоторых говорах «капор» произносили как «капон», а затем добавили суффикс -енко. Тогда Капроненко — потомок человека, носившего капор или шившего такие уборы. Но фонетический переход «р» в «н» нехарактерен для украинского языка, поэтому версия слабая.

Географически фамилия встречается преимущественно в Украине и южных областях России, что подтверждает её украинское происхождение. В дореволюционных метрических книгах Капроненко изредка фиксируются в Полтавской и Херсонской губерниях. Сословная принадлежность не прослеживается однозначно: носители могли быть как казаками, так и крестьянами или мещанами.

Из-за редкости корня однозначного толкования нет. Наиболее вероятно, что фамилия восходит к личному имени Капрон (вариант Киприана), а её носители — потомки человека с таким именем из украинской среды.