Фамилия Капсаланова — женская форма, а её основа мужская — Капсаланов. Корень здесь неочевидный, и сразу бросается в глаза нетипичный для русских фамилий суффикс -ан-. В русской модели фамилий на -ов/-ев он встречается редко и почти всегда указывает на иноязычную основу.

Наиболее вероятное объяснение — тюркское происхождение. В тюркских языках есть слово «капсал» или «капсалан» — в разных диалектах оно может означать «закрытый», «защищённый», «крепостной» или относиться к названию рода. У народов Кавказа и Поволжья встречаются фамилии с корнем «капсал», которые связывают с прозвищем «замкнутый», «нелюдимый» или, наоборот, с обозначением человека из укреплённого поселения. Суффикс -ан в таких фамилиях часто выполняет ту же роль, что и русский -ов: указывает на принадлежность («из рода Капсала»).

Вторая версия, менее вероятная, — греческая. В понтийском диалекте есть слово «капсали» (καψάλι) — «головня», «обгоревшее полено». Прозвище Капсалан могли дать человеку со смуглой кожей или смуглыми волосами. Но эта гипотеза слабее, потому что греческие фамилии на -ан чаще оканчиваются на -анис или -анос, а -ов в конце — уже русская адаптация.

Географически фамилия тяготеет к югу России: её носители встречаются в Дагестане, Чечне, Ставропольском крае, а также среди тюркоязычных народов (ногайцы, кумыки). Встречается и у осетин, но реже. Скорее всего, предок носителя фамилии был из тюркской или кавказской среды, а окончание -ов добавили при русификации документов в XIX–XX веках. Это не дворянская фамилия, а народная, образованная от прозвища или родового имени.