Фамилия Карабчикова — женская форма фамилии Карабчиков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Карабчик. Основа здесь — слово «карабчик», которое в южнорусских и украинских говорах имело два основных значения. Первое — уменьшительное от «карабец» или «кораблик»: так могли прозвать человека, имевшего какое-то отношение к судоходству, лодкам или переправе. Второе, более вероятное — «карабчик» как вариант слова «коробчик», то есть человек, делавший короба, корзины, либо торговец, носивший товар в коробе. Фонетическое изменение «о» на «а» (аканье) в безударной позиции — обычное дело для русских говоров, поэтому «короб» превратился в «караб».

Фамилия образована по типичной русской модели: основа Карабчик + патронимический суффикс -ов (чей? — сын Карабчика). Суффикс -чик в данном случае не уменьшительно-ласкательный, а указывает на принадлежность к профессии или характерный признак: Карабчик — это не «маленький корабль», а «коробейник» или «лодочник». Такой способ словообразования был распространён в XVI–XVII веках, когда прозвища, заканчивающиеся на -чик, -щик, закреплялись за целыми семьями.

Встречается фамилия в основном в регионах, где было сильно акающее произношение: на юге России, в Поволжье, а также среди потомков переселенцев на Урал и в Сибирь. В документах XVII века можно найти упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Карабчик, что говорит о недворянском, скорее ремесленном или торговом происхождении фамилии.

Редкий суффикс -чик в основе притяжательной фамилии (обычно такие прозвища давали по занятию, а не по имени отца) отличает Карабчиковых от более частых Коробовых или Кораблёвых. Если предки Карабчикова жили на Волге, версия с «лодочником» весомее; если в чернозёмной полосе — скорее всего, это коробейник, странствующий торговец мелким товаром.