Фамилия Карабешкина — женская форма, а мужская, Карабешкин, образована по типичной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: «чей сын?» — Карабешкин, то есть сын Карабешки. Сама основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Карабешка.

Здесь стоит сразу отбросить версию о связи с «кораблём» (церковнославянское «карабль»). Хотя внешнее сходство есть, в русских говорах и ономастике такая основа не фиксируется. Гораздо правдоподобнее, что в основе лежит диалектное слово «карабешка» — так в некоторых регионах (особенно на юге России и в Поволжье) называли каравая, круглый хлеб, либо небольшую корзину, плетёнку. Прозвище Карабешка могли дать либо хлебосольному, плотному человеку, либо, наоборот, корзинщику или торговцу корзинами.

Фамилия довольно редкая и, судя по географии, тяготеет к южнорусским областям и бывшим казачьим землям. Встречается в документах по Воронежской, Ростовской областям и Краснодарскому краю. В XIX веке Карабешкины числились в основном среди государственных крестьян и мещан. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что прозвище оканчивалось на -а, что характерно для прозвищ, а не для крестильных имён.

Однокоренных фамилий мало, но есть Карабашкин, Карабанов — они могут быть связаны с тюркским «карабаш» (чёрная голова), но Карабешкина стоит в стороне: её основа чисто русская, диалектная, с явным «хлебным» или «плетёным» значением. Так что предки носительницы этой фамилии, скорее всего, были людьми, связанными с пекарным делом или плетением, либо получили прозвище за внешность — круглого, упитанного человека.