Фамилия Карабудаева — яркий пример того, как географическое имя или прозвище, связанное с местностью, превратилось в родовое. Её основа восходит к тюркским языкам, где «кара» означает «чёрный», а «буда» (или «будай») — или «пшеница», или «лёд», или даже «бык». Самый вероятный вариант — «Карабуда» как название тюркского селения или урочища: «чёрная пшеница» (тёмный сорт зерна) или «чёрный лёд» (незамерзающий родник). В Дагестане, Чечне и в кумыкских аулах встречаются топонимы с корнем «Карабуда» — например, село Карабудахкент, где «-кент» означает «селение».

Суффикс «-ев» в фамилии указывает на русскую патронимическую модель, которая «наложилась» на тюркскую основу. По правилам, фамилии на «-ев» образовывались от основ на мягкий согласный или «-а/-я». Здесь исходное имя или прозвище Карабуда (Карабудай) дало форму «Карабудаев», а женский вариант Карабудаева — это просто грамматическое окончание, указывающее на принадлежность к роду.

Носители фамилии чаще всего встречаются в Дагестане, Чечне, Ингушетии и среди тюркоязычных народов Северного Кавказа (кумыков, ногайцев). Это не случайно: фамилия почти наверняка сформировалась в среде, где русская административная система фиксировала местные имена по отчеству. Предки Карабудаевых могли быть жителями аула Карабудахкент или переселенцами из другого села с похожим названием. Прозвище «Карабуда» мог получить человек с тёмными волосами или смуглой кожей, но в контексте кавказской ономастики связь с географией выглядит убедительнее.

В отличие от многих русских фамилий, Карабудаева не имеет отношения к ремёслам или социальному статусу — это чисто топонимическая или прозвищная фамилия, закреплённая за родом, который когда-то ассоциировался с конкретной точкой на карте.