Фамилия Карнилов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Карнилов послужило церковное имя Корнелий. Мужское крестильное имя Корнелий в переводе с латинского означает «рог». В основу фамилии легла производная форма этого имени — Карнил. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Карнил, со временем получил фамилию Карнилов. О точном месте и времени возникновения фамилии Карнилов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Карнилов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.