Основой фамилии Карпущенков послужило церковное имя Карпущ. Карпущ - производная форма мужского крестильного имени Карп, которое образовано от греческого «karpos», что значит «приносить пользу» или «плод». Менее вероятно, что в основе фамилии лежит не христианское, а языческое, народное имя Карпущ, данное по названию рыбы «карп». Давая младенцу такое имя, как Карпущ, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена эта рыба. Фамилия Карпущенков представляет собой отчество второго порядка: Карпущенков — сын Карпущенко и внук Карпущи. А суффикс -енко- указывает на то, что первоначально фамилия Карпущенков, скорее всего, зародилась на территории Украины. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Карпущ, со временем получил фамилию Карпущенков.