Фамилия Карпущенко — яркий пример украинской модели образования фамилий, которая сразу говорит о происхождении своего носителя. Суффикс -енко, один из самых распространённых в Украине, означает «сын» или «потомок». Таким образом, Карпущенко — это буквально «сын Карпука» или «маленький Карпук». В основе фамилии лежит имя Карп, которое пришло в русский и украинский языки из греческого через церковный календарь. Греческое «карпос» означает «плод», так что имя было символичным и благопожелательным.

Интересна промежуточная форма — Карпук. Это не просто уменьшительное от Карпа, а типичный для западноукраинских и белорусских земель способ образования фамилий и прозвищ с помощью суффикса -ук/-юк. Карпук — это либо «маленький Карп», либо, что более вероятно, «слуга» или «человек Карпа» (в значении принадлежности к хозяину или старшему родственнику с таким именем). А уже от этой формы с помощью фамильного суффикса -енко и возникло Карпущенко. Такая цепочка (Карп → Карпук → Карпущенко) встречается реже, чем прямое образование от имени, и это придаёт фамилии региональный колорит — её корни, скорее всего, на западе или в центре Украины.

С социальной точки зрения, фамилия не указывает на дворянское происхождение. В массе своей Карпущенко — потомки крестьян или казаков, у которых фамилии на -енко закрепились в XVII–XVIII веках. В те времена прозвище по отцу было необходимо для учёта в реестрах, и оно просто фиксировало родство: «чей ты?» — «Карпущенко», то есть из рода Карпука.

Сравните с однокоренными фамилиями: Карпенко (прямое образование от Карп с тем же суффиксом) гораздо более распространён и нейтрален географически. Карпущенко же, с его двойным суффиксом, встречается заметно реже и сразу выдает более узкую локальную традицию словообразования. Встречаются также варианты написания через «о» — Карпущенко, но для украинской основы это нетипично, и, скорее всего, это результат русификации фамилии в документах.