Фамилия Капущенко звучит нарочито украински, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -енко — классический маркер украинской антропонимии, который указывает на происхождение от отца или прозвища: буквально «маленький Капуст» или «сын Капуста». В данном случае основа — «капуст-» (с чередованием «с/щ»). Это не фамилия от названия овоща в прямом бытовом смысле, а от прозвища Капуст или Капуста. Такие прозвища в старину давали либо человеку, который занимался разведением капусты (огороднику или торговцу), либо, что встречалось чаще, человеку с крупной головой — по форме кочана. Сравните с фамилиями Капустин, Капусткин, Капустников.

Географически фамилия тяготеет к восточным и центральным областям Украины, откуда шла активная миграция в XIX–XX веках на юг России и в Сибирь. Встречаемость в метрических книгах Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний подтверждает эту локализацию. Интересно, что в белорусском языке есть близкое слово «капуста» в значении «деньги» (жаргонное), но для фамилии эта версия маловероятна — прозвища от денег обычно строятся иначе (Грош, Копейка).

Словообразовательная модель Капущенко — нестандартная. Обычно украинские фамилии на -енко образуются от имен или прозвищ на твердый согласный: Капуст-а → Капущенко, но с чередованием «ст/щ». Это чередование характерно для украинского языка (ср. «міст — міщенко»), что доказывает местное, а не привнесенное происхождение. Встречаются варианты написания Капущенко и Капущенко — второй встречается реже и может быть следствием описки или адаптации в русской среде.

Социальный контекст прост: фамилию носили крестьяне и казаки, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В списках реестрового казачества XVII–XVIII веков прозвище Капуста встречается нередко, так что предки Капущенко могли быть запорожцами или гетманскими казаками, но это лишь вероятная, а не доказанная версия.