Фамилия Карюканов — нечастая, но устроена прозрачно. В её основе лежит прозвище или некалендарное имя Карюкан, а корень — «карюк». Чтобы понять смысл, нужно разобраться с самим словом «карюк». В русских говорах, особенно южных и донских, «карюк» — это коршун, хищная птица. В словаре Даля слово отмечено как диалектное, с пометой «южное». Так могли прозвать человека за внешнее сходство (хищный нос, цепкий взгляд) или за характер — зоркий, хваткий, возможно, склонный к разбою или добычливости. В казачьей среде прозвище Карюк было хорошо известно, и от него пошли фамилии Карюков, Карюкин и, с суффиксом -ан-, Карюканов.

Суффикс -ан- в прозвищах и фамилиях часто выполнял увеличительную или уничижительную роль (ср. старикан, толстян). Карюкан — это «большой коршун» или просто «коршуняка», то есть прозвище с оттенком грубоватой народной экспрессии. Затем к основе Карюкан добавился стандартный русский патронимический суффикс -ов, который отвечал на вопрос «чей?»: сын Карюкана — Карюканов. Таким образом, фамилия означает «потомок Карюкана», а тот, в свою очередь, получил имя от птицы.

Версия о происхождении от тюркского имени или слова (например, от «кара» — чёрный) выглядит менее убедительной: суффикс -ан и окончание -ов указывают на славянскую словообразовательную модель, а не на прямое заимствование. Скорее всего, фамилия сложилась в среде русского или украинского крестьянства и казачества, где диалектная лексика была обычной основой для прозвищ. Географически Карюкановы тяготеют к югу России — к Ростовской, Волгоградской областям, Краснодарскому краю. Фамилия недворянская, нестарая, её носители — потомки вольных или служилых людей, получивших прозвище по меткой народной характеристике.