Фамилия Каржонкова — женская форма фамилии Каржонков. Её основа — прозвище или неканоническое имя Каржонок, а в его корне мы слышим звук «ж», который указывает на возможное чередование с «г». Самая вероятная версия: Каржонок — это западно- или южнорусское произношение слова «каргунок» или «коргунок». В русских говорах «карга» — это не только старуха, но и ворона, а также корявое дерево, пень. «Каржонок» могло быть прозвищем низкорослого, сутулого человека или того, кто жил у болота с корягами. В белорусском языке «каржон» — это небольшой куст или карлик, что добавляет веса этой версии.

Менее распространённая гипотеза связывает фамилию с тюркским словом «каржы» (расход, издержки) или диалектным «каржить» (ворчать, брюзжать). Тогда Каржонок — это ворчун или прижимистый хозяин. Но чередование «ж/г» в славянских фамилиях встречается часто, поэтому первый вариант правдоподобнее.

Суффикс -онок (-ёнок) в фамилиях типичен для северных и центральных областей России, особенно для бывших новгородских земель. Он образовывал «полуотчества»: Каржонок — сын или внук Карги. Со временем фамилия закрепилась в форме Каржонков (чей? — из рода Каржонка), а женский вариант Каржонкова — это уже фамилия по мужу или отцу.

Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, из одной или нескольких деревень, где прозвище дали конкретному человеку. Носители фамилии Каржонкова, вероятно, потомки крестьян или ремесленников, которых в быту называли по отцу или деду, а не по роду занятий.