Фамилия Кавычкина — женская форма фамилии Кавычкин. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я, и здесь как раз такой случай. Основа фамилии — слово «кавычка». Казалось бы, очевидная ассоциация — с типографским знаком препинания, но это значение вторично. В русских говорах «кавычка» издавна означала «крючок», «закорючка», «загогулина», а также «помеха», «препятствие» или «хитрость». Прозвище Кавычка могли дать человеку с извилистым, неспокойным характером, любителю спорить или тому, кто «подковыривал» словами. В некоторых диалектах «кавычка» — это ещё и утка-нырок (по сходству с крючковатым клювом или манерой нырять), так что прозвище могло относиться к охотнику или птицелову.

Суффикс -ин типичен для центральных и северных регионов России, где фамилии образовывали от прозвищ и имён на -а/-я. В южных и восточных областях чаще встречается суффикс -ов, так что Кавычкины — скорее всего, выходцы из Московской, Тверской, Владимирской или новгородских земель. Интересно, что фамилия эта редкая: в дореволюционных справочниках и метрических книгах она встречается отрывочно, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в одном-двух уездах.

В отличие от однокоренных Кавычкин и Кавычков, форма Кавычкина не образовывалась напрямую от профессии или ремесла. Скорее всего, первый носитель фамилии (Кавычкин) получил её от отца по прозвищу Кавычка. Никакой связи с грамотностью или переписчиками книг здесь нет — это народное, диалектное слово, и лишь случайное совпадение с типографским термином создаёт иллюзию «книжной» фамилии. На деле она куда старше и грубее: корни уходят в крестьянский быт, где «кавычка» была скорее обидной кличкой для хитрого или неуживчивого человека.