Фамилия Кайфудтин — редкая, и её разбор требует осторожности: на слух она почти полностью совпадает с арабским именем Кайфуддин (от «кайф» — «радость, наслаждение» и «дин» — «вера, религия»). В исламской ономастике такие имена означают «радость веры» или «услада религии». Однако в русской фамильной модели суффикс -ин указывает на притяжательность: чей? — Кайфудтин. То есть фамилия могла образоваться от имени Кайфуддин через русское окончание -ин, что типично для фамилий из татарской, башкирской или кавказской среды, попавших в российские метрики. Конечное «н» вместо «нн» — следствие упрощения на слух или при записи: вместо Кайфуддин в документах записали Кайфудтин.

Менее вероятна, но возможна и другая версия: основа «кайф» в значении «удовольствие» могла лечь в прозвище Кайфудя, от которого через суффикс -тин (сравните: Марфутин, Федютин) образовали фамилию. Но это гипотеза без надёжных параллелей: суффикс -тин в русских фамилиях встречается реже, чем -ин, и обычно привязан к основам на мягкий согласный или -а/-я. Для фамилии Кайфудтин такая модель выглядит натянутой.

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону и Западной Сибири — местам расселения татар и башкир, где арабские имена с «дин» были обычны. В дореволюционных списках и советских паспортных столах имя Кайфуддин нередко записывали с ошибками: двойное «н» терялось, а огласовка смещалась. Так Кайфуддин превращался в Кайфудтина, а затем и в Кайфудтина как фамилию.

Если фамилия ваша, скорее всего, предки носили имя Кайфуддин — духовное лицо, мулла или просто набожный человек из татарской или башкирской семьи. Фамилия закрепилась в XIX — начале XX века, когда мусульманам начали массово присваивать фамилии по отцу.