Фамилия Казгунова — женская форма фамилии Казгунов. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от мужских прозвищ или имен, оканчивающихся на твердый согласный: Казгун → Казгунов. В основе лежит прозвище Казгун, и его происхождение спорно — но одна версия заметно правдоподобнее других.

Самая вероятная версия: прозвище связано с тюркским корнем «каз» (гусь) и суффиксом «-гун», который в тюркских языках образует названия лиц по характерному признаку или действию. Казгун — «гусятник», человек, который разводит гусей, пасёт их или торгует ими. В степных и южнорусских регионах, где контакт с тюркскими народами был плотным, такие прозвища давали по хозяйственному занятию. Фамилия встречается в Башкортостане, Татарстане и прилегающих областях — это косвенно подтверждает тюркскую основу.

Менее убедительная версия выводит Казгун из русского слова «казга» — устаревшего названия кожаной сумки или мешка. Но это слово редкое и локальное, а суффикс «-гун» для русского именослова нетипичен: в русских прозвищах чаще встречаются суффиксы -ун (бегун, крикун) или -ак (казак). Поэтому тюркское объяснение выглядит логичнее.

Фамилия Казгуновых не относится к числу дворянских или старых боярских родов: она из поздних крестьянских и мещанских фамилий, которые закрепились в XIX веке при массовом учёте населения. Носители фамилии в основном происходят из смешанных русско-тюркских регионов, где прозвище могло возникнуть в бытовом общении.

Сравните с однокоренными фамилиями: Казганов (тот же корень, но с другим суффиксом), Казаков (от «казак») — но Казгунов стоит особняком, и его тюркский след делает фамилию характерным маркером юго-восточного пограничья России.